第二篇章，原生花
1.片尾曲后，主角回到自己房间
2.研究所找大木博士，得知方元地区已开放
3.到船之屋右边客服买票前往方元地区
赤之镇
1.下了船，一路来到赤之镇
2.打败赤之道馆
3.右边山洞卡比熊挡住洞口，前往树果小屋触发精灵笛剧情，再次前往洞口唤醒卡比熊(捕捉，不捕捉下次再次出现)
4.右下角研究所注入晶石交换精灵(火雉鸡 水跃鱼 木守宫)
5.镇下边天气预报中心打败屋内4个暗之兵团，可获得：蚊香蝌蚪B
6.穿过山洞，来到黄之镇
黄之镇
1.道馆没钥匙进不去，到小镇右边和龙爷对话，得知钥匙在太空馆
2.前往小镇坐下边的天空馆，和研究员战斗取得钥匙
3.打败道馆后，来到河边按【空格键】使用沼蛙跳来到对岸 之后一路来到蓝之镇
蓝之镇
1.通道前遇到对手舞美拉的挑战
2.进入道馆需要输入歌曲的数字隐语
3.买票进入精灵歌剧院 点石榴石这首歌 根据歌曲按动歌词，最后会出现数字隐语，记录下来
4.左下角民居教乔伊学习：高级治疗 获得：精灵球-(快乐蛋)
5.输入数字隐语进入道馆 打败道馆馆主
6.穿过过通道一路来到绿之镇
绿之镇
1.下方民居和女孩对话可获得：零食
2.发现道馆门关着，问路人得知钥匙在小镇左边天然迷宫的其中一只天然雀身上
3.前往迷宫，找到钥匙后再次来到道馆
4.打败道馆后电话再次响起，还是博士打来的，创始村下面的海域已经开通，可以前往方元四岛了
5.飞行回到创始村，下方水域游水来到方元四岛
珊瑚岛 - 青之镇
1.首先向左来到珊瑚岛
2.左边民居小女孩对话可获得：零食
3.打败道馆后，利用沼蛙跳来到小镇右边小岛，从老人处得知要进入礁岩岛必须持有精灵通行证
4.来到礁岩岛，被2只豪力挡住去路
5.前往精灵联盟左边办事处办理精灵通行证
6.之后就可以进入礁岩岛了
礁岩岛 - 橙之镇
1.礁岩岛都是精灵商人，里面有卖很多商店没卖的物品，可以看看
2.进入礁岩岛没有特别任务，直接打败道馆
炼空岛 - 白之镇
1.道馆馆主不在，前往小镇左边冰之洞窟，走到最深处遇到馆主
2.冰之洞窟最深处可获得：神秘蛋
3.之后往下来到狱法岛
狱法岛 - 紫之镇
1.小岛前被暗之兵团的人挡住了去路
2.来到前方的陆地登陆，看到一个暗之兵团的成员猥琐地躲在那里，上去和他对话并购买暗之团制服
3.再次来到小岛，打开物品栏，穿上制服后，就可进入紫之镇
4.左边暗之兵团总部顶层可挑战头目，无限次挑战 有几率获得：红色宝石和蓝色宝石
5.搜集齐16个徽章后，就有资格挑战终极联盟了
6.再次来到联盟，门口处选择终极联盟
7.战胜终极联盟后，就可以到联盟右边小房间选择开通特典和挑战四神器了
8.胜利后再次回到家里，出了门口遇到舞美拉 称电视上报道出现不明精灵
9.战胜终极联盟后，地图上很多地方的神兽都会开启
10.通过终极联盟后，舞美拉会一直在珊瑚岛上修行，可以无限次向她挑战
通过终极联盟后，在火之都右边遗迹，触发暗之兵团与超梦事件
方元地区黄之镇可以进入歌姬小屋，与歌姬对战有机会获得：天空宝石
1.终极联盟通过后，水之都海域随机遇到拉帝亚斯
2.终极联盟通过后，方元四岛海域随机遇到拉迪欧斯
地图等级90级限制解除后，沙漠右边秘洞用怪力推开巨石后，进入出现太古盔甲
最终 Gero
1.战胜终极联盟后，就可以进行原生花和 Gero的剧情了
2.创始村民居和博士处听到关于原生花的消息，前往狱法岛-紫之镇与月见老人对话
3.要想获得原生花必须搜集8块原生花碎片，搜集齐后再次会见月见老人
4.月见老人修复原生花，之后拿着原生花来到岛上方的黑洞，进入黑洞
5.黑洞一片漆黑，走到指定地点会有箭头指示，照着箭头方向走，最后来到Gero处
6.挑战最终 Gero (建议学习5个战斗形态后再来挑战 Gero特有的属性加护可以使精灵对该属性的攻击免疫)
四把神兵器也是有属性的，利用属性的弱点攻击，身上如果有多余的钱全部去购买加身体基值的要:攻击之源 等
- 黑灯谢幕 -
精灵列表
全精灵捕捉条件列表(Gero 注)：
No.001 妙蛙种子 草之都左边森林触发妙蛙种子剧情，救治后再进森林可遇妙蛙种子
No.004 小火龙 雷之都左边民居小女孩对话，然后到小河右边洞口处触发小火龙剧情
No.007 杰尼龟 水之都民居老奶奶处得知杰尼龟兵团出现在草之都，到船之屋门口触发剧情
No.010 绿毛虫 野外遇到
No.013 独角虫 野外遇到
No.016 波波 野外遇到
No.019 小拉达 野外遇到
No.021 烈雀 野外遇到
No.023 阿柏蛇 野外遇到
No.027 穿山鼠 野外遇到
No.029 尼多兰 野外遇到
No.032 尼多朗 野外遇到
No.037 六尾 野外遇到
No.041 超音蝠 野外遇到
No.043 走路草A 野外遇到
No.046 派拉斯 野外遇到
No.048 毛球 野外遇到
No.050 地鼠 野外遇到
No.052 喵喵 野外遇到
No.054 可达鸭 野外遇到
No.056 怒猴 野外遇到
No.058 卡蒂狗 火之都左边民宅用火之石交换获得
No.060 蚊香蝌蚪A 野外遇到
No.063 凯西 野外遇到
No.066 腕力 岩山隧道深处遇到
No.069 喇叭草 野外遇到
No.072 玛瑙水母 野外遇到
No.074 小拳石 野外遇到
No.077 小火马 野外遇到
No.079 呆呆兽 野外遇到
No.081 小磁怪 核能发电厂遇到
No.083 大葱鸭 狩猎场遇到
No.084 嘟嘟 野外遇到
No.086 小海狮 野外遇到
No.088 臭臭泥 野外遇到
No.090 大舌贝 野外遇到
No.092 鬼斯 幽灵塔遇到
No.095 大岩蛇 25级限制解除后，岩山隧道遇到
No.096 素利普 野外遇到
No.098 大钳蟹 野外遇到
No.100 雷电球 核能发电厂
No.102 蛋蛋 野外遇到
No.104 可拉可拉 野外遇到
No.106 沙瓦朗 获得胜利之证后到武之都巅峰塔交换
No.107 艾比郎 获得勇气之证后到武之都巅峰塔交换
No.108 大舌怪 野外遇到
No.109 瓦斯弹 野外遇到
No.111 铁甲犀牛 野外遇到
No.113 快乐蛋 方元地区蓝之镇左下角民居 教乔伊高级治疗后获得
No.114 蔓藤怪 野外遇到
No.115 袋龙 狩猎场遇到
No.116 墨海马 野外遇到
No.118 独角鱼 野外遇到
No.120 海星星 野外遇到
No.122 吸盘魔偶 草之都精灵中心二楼用毛球交换
No.123 飞天螳螂 方元地区太空馆门口
No.127 大角 胜利之路前的海域，左边有个缺口进去一直往里，打败一次联盟后出现
No.128 肯泰罗 狩猎场遇到
No.129 鲤鱼王 野外遇到
No.131 背背龙 通过超级联盟后，在炼空岛冰洞对面小岛出现
No.134 伊布 水 岩之都民居属性晶石交换
No.135 伊布 雷 岩之都民居属性晶石交换
No.136 伊布 火 岩之都民居属性晶石交换
No.137 3D龙 炼空岛精灵中心二楼用大葱鸭交换
No.138 菊石兽 地图等级20级限制解除后，水之都水域土之遗迹碎岩遇到
No.140 化石盔 地图等级15级限制解除后，水之都水域土之遗迹碎岩遇到
No.142 化石翼龙 地图等级75级限制解除后，水之都水域火之遗迹碎岩遇到
No.144 急冻鸟 武之都剧情获得
No.145 闪电鸟 地图等级85级限制解除后，核能发电厂最深处出现
No.146 火焰鸟 地图等级85级限制解除后，沙漠中出现
No.147 迷你龙 地图等级40级解除限制后，狩猎场水池遇到
No.150 超梦 通过终极联盟后，在火之都右边遗迹，触发暗之兵团与超梦事件
No.151 梦幻 开通特典后，在梦之都使用能量水晶后，梦幻出现
No.152 菊草叶 武之都巅峰塔旁民居家小女孩用蜂蜜获得
No.155 火球鼠 沙漠右下角坛子放入零食，下次再来的时候出现
No.158 小锯鳄 学会冲浪后，在岩之都左边的池塘空地里遇到
No.161 尾立 野外遇到
No.163 咕咕 野外遇到
No.165 芭瓢虫 野外遇到
No.167 草蜘蛛 野外遇到
No.170 灯笼鱼 野外遇到
No.172 皮丘 岩之都右民居小孩说话，精灵中心二楼学习紧急救治，博物馆后剧情获得
No.173 皮宝宝 月见山
No.174 宝宝丁 月见山
No.175 波克比 方元地区冰洞深处获得神秘蛋，拿到云之都研究所孵化
No.177 天然雀 野外遇到
No.179 咩利羊 野外遇到
No.182 走路草B 武之都精灵中心二楼用脱壳忍者交换
No.185 爱哭树 火之都民宅培养乐观性格换取皮皮鲸水壶，狩猎场对着奇怪的树浇水发生剧情
No.186 蚊香蝌蚪B 赤之镇下天气预报中心大楼打败暗之兵团获得
No.191 向阳籽 火之都教室小女孩对话，岩石隧道出口出现
No.193 噪音蜻蜓 野外遇到
No.194 乌波 野外遇到
No.196 伊布 阳 岩之都民居属性晶石交换
No.197 伊布 月 岩之都民居属性晶石交换
No.198 黑夜乌鸦 装备哀思铃走出幽灵塔后野外出现
No.203 麒麟奇 狩猎场或野外遇到
No.204 榛果球 火之都往鬼之都通道口闪光处
No.207 天蝎 沙漠遇到
No.209 布鲁 野外遇到
No.214 克拉克劳斯 狩猎场焦炎塔旁坛子放入零食，下次再过来时出现
No.215 扭拉 方元四岛冰之洞窟
No.216 小小熊 出现在岩石隧道岩石上，走上左边岩石，按空格键可跳到对面
No.218 熔岩虫 野外遇到
No.227 钢铁鸟 地图等级60级限制解除后，云之都民居小孩对话，之后在云之都右边野外遇到
No.228 黑暗犬 装备哀思铃走出幽灵塔后野外出现
No.231 小小象 野外遇到
No.234 惊角鹿 精灵狩猎场
No.238 小迷唇 水之都海域冰之遗迹使用碎岩后出现，拿到云之都化石研究所孵化
No.239 小电击怪 核能发电厂前山洞推动巨石获得雷纹蛋，拿到云之都研究所敷化
No.240 鸭嘴龙 沙漠秘洞获得火纹蛋，拿到云之都研究所孵化
No.241 大奶贯 方元地区野外遇到
No.243 雷公 获得七彩圣石触发焦炎塔三圣兽事件并通过超级联盟后，胜利之路遇到
No.244 炎帝 获得七彩圣石触发焦炎塔三圣兽事件并通过超级联盟后，沙漠中遇到
No.245 水君 获得七彩圣石触发焦炎塔三圣兽事件并通过超级联盟后，方元四岛水域遇到
No.246 由基拉 开通特典后，进入龙之都下方龙之秘境后遇到
No.249 鲁基亚 开通特典后，炼空岛冰洞最深处出现
No.250 七彩凤凰 开通精灵特典后，龙之都观龙塔顶闪光点使用闪光后出现
No.251 雪拉比 开通特典后，摇动狩猎场深处一棵闪光的树后出现
No.252 木守宫 赤之镇研究所注入8颗草结晶后获得
No.255 火雉鸡 赤之镇研究所注入8颗火结晶后获得
No.258 水跃鱼 赤之镇研究所注入8颗水结晶后获得
No.261 恶狼犬 野外遇到
No.263 蛇纹熊 野外遇到
No.267 狩猎凤蝶 草之都精灵中心二楼培养善良性格交换
No.269 毒粉蝶 龙之都精灵中心二楼培养忍耐性格交换
No.270 莲叶童子 野外遇到
No.273 橡实果 野外遇到
No.276 傲骨燕 野外遇到
No.278 长翅鸥 野外遇到
No.280 拉鲁拉丝 狩猎场遇到
No.283 水蜘蛛 野外遇到
No.285 蘑蘑菇 野外遇到
No.287 懒人翁 野外遇到
No.290 土居忍士 野外遇到
No.292 脱壳忍者 土居忍士进化后自动加入
No.293 咕妞妞 野外遇到
No.296 幕下力士 野外遇到
No.298 露力丽 野外遇到
No.299 朝北鼻 核能发电厂前山洞碎岩出现
No.304 小小龙 学会怪力后岩山隧道推开巨石遇到
No.309 落雷兽 野外遇到
No.311 正电拍拍 核能发电厂Lv：25解除后出现
No.312 负电拍拍 核能发电厂Lv：25解除后出现
No.318 利牙鱼 野外遇到
No.320 皮皮鲸 野外遇到
No.322 呆火驼 野外遇到
No.324 煤炭龟 雷之都正下方漆黑山洞地图等级65级限制解除后遇到
No.325 跳跳猪 野外遇到
No.328 大额蚁 野外遇到
No.331 沙漠奈亚 沙漠遇到
No.333 小云雀 野外遇到
No.337 月亮石 沙漠中使用碎岩后出现
No.338 太阳岩 沙漠中使用碎岩后出现
No.341 龙虾小兵 野外遇到
No.347 太古羽虫 地图等级90级限制解除后，沙漠右边秘洞用怪力推开巨石后，进入出现
No.355 夜骷髅 精灵塔顶层
No.357 草飞龙 方元地区野外遇到
No.359 阿勃梭鲁 狱法岛出现
No.360 快乐兽 蓝之镇精灵中心二楼用大舌怪交换获得
No.363 海豹球 炼空岛冰洞
No.371 宝贝龙 开通特典后，进入龙之都下方龙之秘境后遇到
No.374 铁哑铃 开通特典后，进入龙之都下方龙之秘境获得化石，拿到云之都研究所顶层复原
No.377 雷吉洛克 地图等级85级限制解除后，水之都水域土之遗迹遇到
No.378 雷吉艾斯 地图等级85级限制解除后，水之都水域冰之遗迹遇到
No.379 雷吉斯奇鲁 地图等级85级限制解除后，水之都水域火之遗迹遇到
No.380 拉迪亚斯 终极联盟通过后，水之都海域遇到
No.381 拉迪欧斯 终极联盟通过后，方元四岛海域遇到
No.382 盖欧卡 开通特典，获得蓝色宝石后，水之都道馆门口石柱上使用，打开洞口后遇到
No.383 固拉多 开通特典，获得红色宝石后，在沙漠秘洞放入太阳岩和月亮石的精灵球，进入洞
No.384 天空之龙 开通特典并获得天空宝石后，云之都绿色图案空地石柱放入宝石后出现
No.385 基拉祈 开通特典，方元地区瀑布左边神社祈祷后出现
No.386 迪奥西斯 开通特典，方元四岛的秘境将所有进化宝石放进去后出现
No.387 草苗龟 开通特典后，进入龙之都下面龙之秘境，培养皮皮【坚强】性格后获得
No.390 小火焰猴 开通特典后，进入龙之都下面龙之秘境，培养皮皮【好斗】性格后获得
No.393 波加曼 开通特典后，进入龙之都下面龙之秘境，培养皮皮【沉稳】性格后获得
No.396 姆克鸟 开通特典后，进入龙之都下面龙之秘境，培养皮皮【极端】性格后获得
No.403 小猫怪 开通特典后，进入龙之都下面龙之秘境，培养皮皮【霸道】性格后获得
No.446 小卡比熊 方元地区山洞口，遇到后前往树果小屋取得精灵笛，之后再次前往唤醒卡比熊
No.447 力欧路 岩山隧道深处遇到
No.458 小球飞鱼 方元地区蓝之镇警察局对话获得
No.470 伊布 叶 岩之都民居属性晶石交换
No.471 伊布 冰 岩之都民居属性晶石交换
No.483 帝牙卢卡 开通特典后，炼空岛上边精灵球图案正中间按空格使用闪光后出现
No.484 帕路绮岈 开通特典后，礁岩岛右边精灵球图案正中间按空格使用闪光后出现
No.487 骑拉帝纳 开通特典后，狱法岛左边精灵球图案正中间按空格使用闪光后出现
No.488 克雷色利亚 开通特典，云之都右边空地出现
No.491 噩梦神 开通特典，装备哀思铃登上幽灵塔塔顶遇到
No.492 洁咪 开通特典后，在创始村上方草地遇到，打败后变成飞翔形态
No.493 阿尔宙斯 开通特典后，方元地区太空馆放入17颗属性晶石后出现
No.??? 机甲超梦梦 剧情遇到，战胜超级联盟并捕捉超梦后，方元地区太空馆内再次出现
No.??? 暗黑鲁基亚 获得4把神兵器后，暗黑鲁基亚解除封印，在禁地出现(捕捉不能)
精灵箱子1至8号
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